Op 5 juli 1866 trouwde Helena met de verpauperde Duitser Christiaan van Sleeswijk-Holstein-Sonderburg-Augustenburg. Het koppel bleef in Groot-Brittannië wonen, dichtbij haar moeder. Dit kwam omdat Victoria haar dochters graag bij haar in de buurt wou hebben. Helena werd later, samen met haar jongste zus Beatrice, een onofficiële secretaresse van de koningin.
Na 22 januari 1901, de dag dat koningin Victoria overleed, zag ze haar broers en zussen nog weinig.
Helena en Christiaan woonden eerst in Frogmore House op het landgoed van Windsor Castle en later in Cumberland Lodge in Windsor Creat Park.
